游戏依旧采用赛璐珞风格的绘图方式构成，最多可支持4个同时游戏，玩家需要在广大的地图场景中探险，打倒陆续出现的敌人，突破重重的关卡。游戏中重现了卡通动画中4名忍者龟各自的武器与招式，配音也都是由卡通的配音员负责，让玩家可以重温当年忍者龟的原味。在故事模式中，玩家扮演四位忍者神龟与数之不尽的敌人战斗，最后碰上他们的宿敌施莱德。四位忍者神龟都有其各自的能力。该作的故事模式共有30个舞台，包括15个战斗关卡和15个骑乘关卡。